大分県の宇佐八幡宮から勧請し、当初は黒杭に鎮座していた。833（天長10）年に宮本に移されたという。
もとは吾田（あだ）八幡宮という名前だった。ある年の５月の田植えの際、田の中に神様へのお供え物が下り、霊験あらたかであったことから代田と改称したという。
現在の社殿は 1924（大正13）年の再建。本殿は江戸時代の建造物。
1876（明治6）年郷社となり、戦前まで経費の一部が市町村費でまかなわれていた。戦後は政教分離で郷社ではなくなり、「郷社」の文字は消された。
石鳥居（市有形文化財）
一の鳥居で、材質は花崗岩。
1639（寛永16）年薩摩の石工木賀兵衛の作。つくられた年が明らかな鳥居では県内で4 番目、市内では賀茂神社の鳥居に次いで古いものとされている。
同じ石工がつくった鳥居は県内に4基現存し、代田八幡宮、賀茂神社（以上柳井市）、防府天満宮（防府市）、志駄岸八幡宮（周防大島町）にある。
大歳神社
もとは鷺社と呼ばれていたが、1908（明治41）年の神社合併令により、6か所にあった大歳神社を合併して現在地に移し、翌年に大歳神社と改称した。
生目神社（いきめじんじゃ）
平景清（かげきよ）をまつっている。眼病の神として広く崇敬されている。
恵比須神社
1910（明治43）年の神社合併により現在地にまつられている。
茶臼山神社
1893（明治26）年、茶臼山古墳の調査の後に、茶臼山の頂部に建立。
1993（平成5）年、古墳の発掘整備に伴い、御神体や祠等を代田八幡宮に移した。
